并且當(dāng)Trp兩者中的一個(gè)漸變
2014-09-09 14:08 來(lái)源:http://m.sustainablelifeonearth.com/ 閱讀: 次研討職員揣測(cè),這種結(jié)合能引誘FucP封閉時(shí),朝外結(jié)構(gòu)中一個(gè)構(gòu)象的變更,這樣Trp38跟Trp278就能瀕臨聯(lián)合糖,構(gòu)成一種“被關(guān)閉(occluded)”的旁邊體構(gòu)造。這兩個(gè)Trp殘基的地位也提出了一種剖析FucP結(jié)構(gòu)能源學(xué)的特別方式。
固然大腸桿菌中FucP相關(guān)晶體結(jié)構(gòu)得以報(bào)道,然而對(duì)于FucP構(gòu)象動(dòng)力學(xué)目前還并不明白。在這篇文章中,研究人員通過(guò)熒光光譜法,解析了巖藻糖(L *** fucose)同向轉(zhuǎn)運(yùn)體的動(dòng)力學(xué)機(jī)制。
2010年,顏寧研究組在Nature雜志上發(fā)表文章,報(bào)道了大腸桿菌巖藻糖(L *** fucose)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(FucP)結(jié)構(gòu)與功效。FucP附屬于Major Facilitator Superfamily (MFS)超家族。MFS超家族轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白是一類十分古老、在各個(gè)物種中都起著重要作用的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,目前已知一級(jí)序列的家族成員超過(guò)一萬(wàn)個(gè),它們?cè)陴B(yǎng)分物資和代謝產(chǎn)物的轉(zhuǎn)運(yùn)、細(xì)菌抗藥性以及神經(jīng)信號(hào)傳導(dǎo)等各種生理過(guò)程中起側(cè)重要作用。因?yàn)镸FS轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的主要生理功能,它們的結(jié)構(gòu)與功能受到了普遍的關(guān)注。
通過(guò)進(jìn)一步的研究,研究人員還發(fā)明Trp38,或者Trp278中任何一個(gè)被調(diào)換(尤其是前者),都會(huì)引起熒光淬滅,從而下降了巖藻糖的名義親和力,克制巖藻糖活性轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)程,清華大學(xué)中層培訓(xùn),這闡明這兩個(gè)殘基可能直接才干與了巖藻糖的結(jié)合。
研究人員發(fā)當(dāng)初純化的FucP中增加巖藻糖,會(huì)以一種依附于濃度的方法,無(wú)需λmax的改變,就能誘導(dǎo)色氨酸Trp熒光20%的淬滅。這一過(guò)程當(dāng)Trp38和Trp278被Tyr或者Phentermine替換的時(shí)候,會(huì)被撤消,而Trp38和Trp278這兩者恰是定位于朝外結(jié)構(gòu)的絕對(duì)面上,并且當(dāng)Trp兩者中的一個(gè)漸變,也會(huì)降低淬滅。因而這兩個(gè)色氨酸殘基都介入了這一景象。
來(lái)自加州大學(xué)洛杉磯分校,清華大學(xué)生科院與醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)表了題為“Dynamics of the l *** fucose/H+ symporter revealed by fluorescence spectroscopy”的文章,通過(guò)熒光光譜法,揭示了巖藻糖(L *** fucose)同向轉(zhuǎn)運(yùn)體的動(dòng)力學(xué)機(jī)制,并提出了分析FucP結(jié)構(gòu)動(dòng)力學(xué)的一種新方法。相關(guān)結(jié)果頒布在《美國(guó)國(guó)度迷信院院刊》(PNAS)雜志上。
起源:生物通 2012 *** 09 *** 04 萬(wàn)紋
文章的通信作者是加州大學(xué)洛杉磯分校生理學(xué)家H. Ronald Kaback,清華大學(xué)生科院顏寧教學(xué),以及孫林風(fēng)(Linfeng Sun,音譯)參加了此項(xiàng)研究,重要為這項(xiàng)研究供給了相干的分析工具和辦法。
清華大學(xué)顏寧與加州大學(xué)配合發(fā)PNAS文章
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